En el ranking universitario de Latinoamérica 2016 emitido por la firma QS Worlwide Wniversity Rankings, Guides & Events de Inglaterra, Univalle hace parte de las 50 de mayor reputación. El estudio tiene en cuenta a 300 universidades, La Universidad figura, de acuerdo con esta última clasificación, en el puesto 48.  Desde 2009 Univalle no hacía parte de este selecto grupo de centros de formación superior.   

Según la organización QS que establece rankings en los distintos continentes y es consultada mundialmente por millones de aspirantes a ingresar a la universidad, otras cuatro universidades colombianas integran la representación colombiana en la clasificación.  Son en su orden: la U. de los Andes, la U. Nacional, La U de Antioquia y la U. Javeriana. 

En Colombia, la Universidad del Valle hace parte del Top 4 de las más importantes universidades en temas como certificación de los posgrados, calificación de los grupos de investigación, patentes obtenidas, número de docentes con Ph.D, entre otros indicadores.